Die hier vorgestellte Unterart ist in Kultur weit verbreitet. Allerdings sind sich die Experten darüber uneins, ob es sich dabei wirklich um eine Unterart von Gymnocalycium horstii oder doch um eine eigene Art handelt. So wurden die Pflanzen von Buining (in KuaS 9/1970) zunächst als "Gymnocalycium horstii var. buenekeri" beschrieben. Leider war diese Beschreibung ungültig, da Buining kein Typusexemplar bestimmt hatte. Acht Jahre später beschrieb Swales die Pflanzen schließlich (gültig) als eigenständige Art. Als Begründung hierfür führt er Unterschiede bei Farbe und Textur des Körpers (dunkelgrün statt frisch grün, matt statt glänzend), der Bedornung (etwas kräftiger), der Blütenfarbe (Rosatöne statt überwiegend weiß), der Früchte (grün, nicht bewachst und mit weniger Schuppen) und der Samen (die Oberfläche mit Vertiefungen statt ohne) an. Nach J. Pilbeam (1995) sprosst "Gymnocalycium buenekeri" zudem schon in jungen Jahren, während Gymnocalycium horstii erst im Alter sprosst. Allerdings weist A. Hofacker (in KuaS 2/1999) darauf hin, dass auch bei Gymnocalycium horstii Pflanzen mit matter Epidermis vorkommen und dass die Bedornung nicht bei allen Pflanzen von "G. buenekeri" kräftiger als bei Gymnocalycium horstii ist. Außerdem gilt die Blütenfarbe heute nicht mehr als bedeutsames Merkmal zur Unterscheidung von Arten. Somit bleiben lediglich die Unterschiede bei Früchten und Samen, sowie das ca. 150km weiter nordwestlich gelegene Verbreitungsgebiet. Ob diese Unterschiede den Status einer eigenständigen Art rechtfertigen, liegt im Ermessen des jeweiligen Autors. So führen J. Pilbeam (1995), N. Gerloff + D. Metzing (in KuaS 2/2002), E. F. Anderson (2005) und D. Metzing (2012) die Pflanzen als eigenständige Art, während sie D. Hunt (2006), G. Charles (2009) und R. Correa Pontes (in KuaS 8/2014) (nach der uns leider nicht vorliegenden Umkombination durch P. J. Braun + A. Hofacker im Jahr 2002 (in Schumannia 3 (2002)) - wobei A. Hofacker die Pflanzen drei Jahre zuvor (in KuaS 2/1999) ebenfalls noch als eigene Art führte) als Unterart von Gymnocalycium horstii behandeln. Gymnocalycium horstii ssp. buenekeri ist (wie auch Gymnocalycium horstii ssp. horstii) Teil der Untergattung Macrosemineum. Leider sind die Pflanzen am heimatlichen Standort stark gefährdet, da die wenigen Vorkommen (derzeit sind nur fünf bekannt) durch illegales Aufsammeln stark dezimiert wurden. Dadurch besteht die Gefahr, dass sich die Populationen nicht mehr regenerieren können, da die Zweihäusigkeit der Pflanzen dazu führt, dass nur selten Früchte gebildet werden.

In Kultur ist die hier vorgestellte Unterart problemlos, wenn man beachtet, dass sie in den Sommermonaten lieber halbschattig steht. Zudem ist auf eine regelmäßige Wasserversorgung zu achten (einige Autoren empfehlen, die Pflanzen auch im Winter leicht feucht zu halten, da sonst die Faserwurzeln absterben; wir überwintern unsere Pflanze aber seit Jahren trocken (und kühl) und hatten damit bisher nie Probleme). Als Substrat wird eine humusreiche, jedoch trotzdem durchlässige Erdmischung (ca. 1/3 humos zu 2/3 mineralisch) empfohlen.